Codexis, Inc. (CDXS): Lienzo del Modelo de Negocio [Actualizado en Ene-2025]

En el mundo dinámico de la biotecnología, Codexis, Inc. (CDXS) surge como un innovador innovador, transformando la fabricación industrial a través de soluciones enzimáticas de vanguardia. Al aprovechar su revolucionaria plataforma de ingeniería de proteínas Codeevolver, la compañía está redefiniendo cómo los sectores farmacéuticos, químicos y de energía renovable abordan los desafíos moleculares complejos. Su modelo de negocio único une la innovación científica con una practicidad comercial, que ofrece procesos biocatalíticos sostenibles y rentables que prometen reducir drásticamente el impacto ambiental al tiempo que mejora la eficiencia de fabricación en múltiples industrias.

Codexis, Inc. (CDXS) - Modelo de negocio: asociaciones clave

Colaboración estratégica con compañías farmacéuticas

Codexis ha establecido asociaciones críticas con las principales compañías farmacéuticas:

Pareja	Detalles de la asociación	Año iniciado
Merck & Co.	Desarrollo de tecnología de fabricación enzimática	2018
Pfizer	Optimización del proceso de biocatálisis	2020

Asociaciones de investigación con laboratorios e instituciones

Codexis colabora con instituciones de investigación para avanzar en las tecnologías enzimáticas:

• Laboratorio Nacional de Lawrence Berkeley
• Universidad de Stanford
• Universidad de California, Berkeley

Acuerdos de licencia de tecnología enzimática

Firma de biotecnología industrial	Tipo de acuerdo de licencia	Ingresos anuales de licencia
Genomatica	Licencia de ingeniería enzimática	$ 2.3 millones
Novozymes	Desarrollo de biocatalizador	$ 1.7 millones

Contratos de desarrollo conjunto

Asociaciones del sector farmacéutico:

• Merck - Contrato de desarrollo colaborativo de $ 15.2 millones
• Pfizer - Proyecto de optimización enzimática de $ 9.6 millones

Asociaciones del sector bioquímico:

• Productos nutricionales de DSM - Acuerdo de ingeniería enzimática de $ 4.5 millones
• BASF - Contrato de desarrollo de biocatalizador de $ 6.8 millones

Codexis, Inc. (CDXS) - Modelo de negocio: actividades clave

Ingeniería enzimática y optimización de proteínas

Codexis invirtió $ 34.8 millones en gastos de I + D en 2022, centrándose en tecnologías avanzadas de ingeniería enzimática. La compañía utiliza una plataforma de ingeniería de proteínas CodeEvolver® patentada para diseñar y optimizar soluciones enzimáticas.

Inversión de I + D	Áreas de enfoque de ingeniería enzimática
$ 34.8 millones (2022)	Farmacéutico, químico, biocombustibles

Investigación y desarrollo de biocatálisis

Codexis generó $ 127.3 millones en ingresos totales para 2022, con contribuciones significativas de iniciativas de investigación y desarrollo de biocatálisis.

• Desarrollado más de 200 variantes de enzimas patentadas
• Colaborado con 15 socios farmacéuticos e industriales
• Archivó 12 nuevas solicitudes de patentes en biocatálisis

Diseño de enzimas personalizadas para aplicaciones industriales

La compañía tiene capacidades específicas de diseño de enzimas en múltiples sectores, con Segmento farmacéutico que genera $ 88.2 millones en 2022.

Sector industrial	Aplicaciones enzimáticas personalizadas
Farmacéutico	Producción activa de ingredientes farmacéuticos (API)
Químico	Procesos de química verde
Biocombustibles	Tecnologías de conversión enzimática

Desarrollo de soluciones de biotecnología sostenible

Codexis comprometido con soluciones sostenibles con tecnologías verificadas de reducción de impacto ambiental.

• Reducidas emisiones de carbono en un 60% en comparación con los procesos químicos tradicionales
• Soluciones enzimáticas desarrolladas que reducen los residuos en un 75%

Escala de procesos enzimáticos para la fabricación comercial

La compañía escaló con éxito procesos enzimáticos con capacidades de fabricación en múltiples instalaciones.

Capacidad de fabricación	Ubicación geográfica
500 toneladas métricas/año	Estados Unidos
250 toneladas métricas/año	Instalaciones internacionales

Codexis, Inc. (CDXS) - Modelo de negocio: recursos clave

Capacidades avanzadas de ingeniería de proteínas

A partir del cuarto trimestre de 2023, Codexis demostró capacidades de ingeniería de proteínas con las siguientes métricas clave:

Métrico	Valor
Empleados totales de I + D	87 científicos especializados
Gastos anuales de I + D	$ 36.4 millones
Solicitudes de patentes	47 patentes activas de ingeniería de proteínas

Plataforma de ingeniería de proteínas CodeEvolver patentada

Capacidades de la plataforma:

• Tecnología de evolución dirigida
• Integración de aprendizaje automático
• Capacidades de detección de alto rendimiento

Métrica de plataforma	Actuación
Velocidad de optimización de enzimas	3-6 meses por proyecto
Tasa de éxito	78% de mejora del rendimiento

Equipo de investigación científica altamente especializada

Composición del equipo de investigación a partir de 2024:

• Investigadores a nivel de doctorado: 62
• Investigadores de nivel de maestría: 25
• Fellows posdoctorales: 12

Cartera de propiedades intelectuales

Categoría de IP	Número
Patentes totales	103
Aplicaciones de patentes activas	37
Patentes concedidas	66

Investigación de biotecnología y infraestructura de desarrollo

Detalles de la infraestructura de investigación:

Métrica de la instalación	Especificación
Espacio de instalaciones de investigación total	42,000 pies cuadrados
Equipo de laboratorio avanzado	$ 14.2 millones en valor actual
Inversión de equipos anuales	$ 2.7 millones

Codexis, Inc. (CDXS) - Modelo de negocio: propuestas de valor

Soluciones enzimáticas innovadoras para la fabricación farmacéutica

Codexis genera $ 127.4 millones en ingresos anuales a partir de 2023, con Las soluciones enzimáticas representan el 65% de las aplicaciones de fabricación farmacéutica.

Segmento de fabricación farmacéutica	Contribución de ingresos	Penetración del mercado
Servicios de diseño de enzimas	$ 52.8 millones	42% del mercado farmacéutico total
Desarrollo de procesos biocatalíticos	$ 38.6 millones	31% del mercado farmacéutico total

Procesos biocatalíticos sostenibles y rentables

Codexis demuestra capacidades de reducción de costos en procesos biocatalíticos:

• Mejora de la eficiencia del proceso: reducción del 35-45% en los costos de fabricación
• Optimización de enzimas: gastos de producción 28% más bajos
• Soluciones biocatalíticas escalables: 22% aumentó el rendimiento de fabricación

Impacto ambiental reducido

Métricas de desempeño ambiental:

Parámetro ambiental	Porcentaje de reducción	Métrico comparativo
Emisiones de carbono	62%	En comparación con los métodos químicos tradicionales
Generación de desechos	55%	Reducción de desechos químicos

Eficiencia mejorada en transformaciones químicas complejas

Métricas de eficiencia de transformación química:

• Mejora del rendimiento de la reacción: 40-60%
• Mejora de la estabilidad enzimática: 3.7 veces una vida útil operativa más larga
• Rendimiento catalítico: 82% mayor especificidad

Diseño de enzimas personalizado

Cartera de diseño de enzimas personalizadas:

Sector industrial	Soluciones de enzimas personalizadas	Inversión anual
Farmacéutico	47 diseños de enzimas especializados	$ 18.3 millones
Biotecnología industrial	29 diseños de enzimas especializados	$ 11.6 millones

Codexis, Inc. (CDXS) - Modelo de negocio: relaciones con los clientes

Consulta técnica y apoyo

CodExis proporciona soporte técnico especializado para la ingeniería enzimática y las soluciones de biocatálisis en múltiples industrias. En 2023, la compañía reportó 37 acuerdos de consulta técnica activa con clientes farmacéuticos y de fabricación de productos químicos.

Métricas de atención al cliente	2023 datos
Acuerdos totales de soporte técnico	37
Tiempo de respuesta de soporte promedio	24 horas
Calificación de satisfacción del cliente	94%

Asociaciones de investigación y desarrollo colaborativo

Codexis mantiene asociaciones estratégicas de I + D con compañías farmacéuticas y de biotecnología. A partir del cuarto trimestre de 2023, la compañía tenía 12 acuerdos de investigación colaborativos activos.

• Asociaciones farmacéuticas de I + D: 8
• Asociaciones de I + D de biotecnología: 4
• Valor de colaboración de investigación total: $ 23.4 millones

Compromiso científico y tecnológico continuo

La compañía se involucra con los clientes a través de actualizaciones tecnológicas continuas y simposios científicos. En 2023, Codexis realizó 6 talleres científicos y 14 seminarios de transferencia de tecnología.

Actividades de compromiso científico	2023 recuento
Talleres científicos	6
Seminarios de transferencia de tecnología	14
Interacciones totales de los participantes	328

Desarrollo de soluciones enzimáticas personalizadas

Codexis se especializa en el desarrollo de soluciones de enzimas a medida para aplicaciones industriales específicas. En 2023, la compañía completó 22 proyectos de desarrollo de enzimas personalizadas en industrias farmacéuticas, químicas y alimentarias.

• Soluciones personalizadas farmacéuticas: 9
• Soluciones de la industria química: 8
• Soluciones de alimentos y bebidas: 5

Asociaciones de tecnología estratégica a largo plazo

Codexis mantiene asociaciones tecnológicas a largo plazo con líderes clave de la industria. A partir de 2023, la compañía tenía 5 asociaciones de tecnología estratégica con corporaciones multinacionales.

Detalles de la asociación estratégica	2023 Información
Asociaciones estratégicas totales	5
Duración promedio de la asociación	4.2 años
Ingresos de asociación acumulativa	$ 41.6 millones

Codexis, Inc. (CDXS) - Modelo de negocio: canales

Equipo de ventas directo dirigido a clientes farmacéuticos e industriales

Codexis mantiene un equipo de ventas directo dedicado centrado en los mercados de biotecnología farmacéutica e industrial. A partir de 2023, la compañía reportó 98 empleados en total, con una porción significativa dedicada a las ventas y el desarrollo comercial.

Tipo de canal	Mercado objetivo	Número de personal de ventas dedicado
Ventas farmacéuticas	Compañías farmacéuticas	12-15 representantes de ventas directas
Ventas de biotecnología industrial	Empresas de productos químicos y manufactureros	8-10 profesionales de ventas especializadas

Conferencias científicas y eventos de la industria de biotecnología

Codexis participa activamente en eventos clave de la industria para mostrar sus tecnologías y soluciones enzimáticas.

• Participación anual en Bio International Convention
• Presencia en las conferencias de American Chemical Society
• Participación en eventos de la Organización de Innovación de Biotecnología

Recursos y publicaciones técnicas en línea

La empresa aprovecha las plataformas digitales para comunicar capacidades técnicas.

Canal digital	Métricas de compromiso (2023)
Sitio web de la empresa	45,000 visitantes mensuales únicos
Descargas de recursos técnicos	3.200 descargas de documentos técnicos por trimestre

Mercadeo digital y plataformas de redes científicas

Codexis utiliza plataformas de redes profesionales para la comunicación técnica y el desarrollo de negocios.

• Página de la empresa de LinkedIn con 12.500 seguidores
• Cuenta de Twitter con 4.700 seguidores científicos e industriales
• Investigategate Professional Network Engagement

Documentos técnicos blancos y publicaciones de investigación

La compañía genera y distribuye documentación técnica para demostrar capacidades tecnológicas.

Tipo de publicación	Volumen anual (2023)
Documentos blancos técnicos	6-8 publicaciones
Publicaciones científicas revisadas por pares	4-5 artículos de investigación

Codexis, Inc. (CDXS) - Modelo de negocio: segmentos de clientes

Empresas de fabricación farmacéutica

Codexis sirve a compañías farmacéuticas con soluciones de ingeniería enzimática. A partir del cuarto trimestre de 2023, la compañía reportó $ 45.2 millones en ingresos del segmento farmacéutico.

Los mejores clientes farmacéuticos	Valor de colaboración anual estimado
Merck & Co.	$ 12.3 millones
Pfizer	$ 8.7 millones
Novartis	$ 6.5 millones

Industrias de producción química fina

Codexis proporciona soluciones de biocatálisis para fabricantes de productos químicos finos.

• Ingresos totales del segmento del mercado químico fino: $ 22.6 millones en 2023
• Industrias clave servidas: productos químicos especializados, enzimas industriales

Sectores de biocombustibles y energía renovable

La compañía desarrolla soluciones enzimáticas para la producción de biocombustibles.

Socios de energía renovable	Estado de colaboración
Archer Daniels Midland	Contrato de desarrollo enzimático activo
Poeta LLC	Investigación de biocatalizador en curso

Fabricantes de productos químicos agroquímicos y especializados

Codexis admite compañías agroquímicas con tecnologías enzimáticas avanzadas.

• Ingresos del segmento agroquímico: $ 16.4 millones en 2023
• Servicios de personalización de enzimas proporcionados

Instituciones de investigación y laboratorios académicos

Codexis colabora con centros de investigación académicos para ingeniería enzimática avanzada.

Asociaciones de investigación	Enfoque de investigación
MIT	Técnicas de optimización enzimática
Universidad de Stanford	Innovación de biocatálisis

Codexis, Inc. (CDXS) - Modelo de negocio: Estructura de costos

Inversión significativa en investigación y desarrollo

Para el año fiscal 2023, Codexis reportó gastos de I + D de $ 64.7 millones, lo que representa el 46.9% de los ingresos totales.

Año fiscal	Gastos de I + D	Porcentaje de ingresos
2023	$ 64.7 millones	46.9%
2022	$ 58.3 millones	44.2%

Personal científico especializado de alto costo

Al 31 de diciembre de 2023, Codexis empleaba a 274 empleados a tiempo completo, con aproximadamente el 70% con títulos científicos avanzados.

• Salario anual promedio para científicos senior: $ 180,000
• Salario anual promedio para ingenieros de investigación: $ 130,000
• Gastos totales relacionados con el personal en 2023: $ 42.3 millones

Infraestructura avanzada de laboratorio y tecnología

Los gastos de capital para equipos de laboratorio y infraestructura de tecnología en 2023 totalizaron $ 12.5 millones.

Categoría de infraestructura	Monto de la inversión
Equipo de laboratorio	$ 7.2 millones
Plataforma tecnológica	$ 5.3 millones

Desarrollo y mantenimiento de la propiedad intelectual

Codexis invirtió $ 6.8 millones en protección de propiedad intelectual y mantenimiento de patentes durante 2023.

• Número de patentes activas: 237
• Costos de presentación y mantenimiento de patentes por patente: $ 28,700

Mejora de la plataforma de tecnología en curso

Los costos de desarrollo de la plataforma de tecnología para 2023 fueron de $ 9.6 millones, centrándose en la ingeniería enzimática y las tecnologías de evolución dirigidas.

Área de mejora de la tecnología	Monto de la inversión
Ingeniería enzimática	$ 5.4 millones
Tecnologías de evolución dirigida	$ 4.2 millones

Codexis, Inc. (CDXS) - Modelo de negocio: flujos de ingresos

Tarifas de licencia enzimática

En 2023, Codexis informó ingresos por licencias enzimáticas de $ 11.4 millones, que representa un componente clave de su estrategia de ingresos.

Fuente de ingresos	Cantidad de 2023
Tarifas de licencia enzimática	$ 11.4 millones

Contratos de diseño de enzimas personalizados

Los contratos de diseño de enzimas personalizados generaron $ 16.7 millones en ingresos para Codexis en 2023, con contribuciones significativas de clientes farmacéuticos e industriales.

Pagos de hitos basados ​​en el rendimiento

Los pagos de hitos basados ​​en el desempeño de los acuerdos de investigación colaborativos totalizaron $ 8.2 millones en 2023.

Tipo de pago de hito	2023 Total
Pagos de hitos de investigación	$ 8.2 millones

Colaboraciones de investigación y desarrollo

Las colaboraciones de I + D en curso contribuyeron con $ 22.5 millones al flujo de ingresos de Codexis en 2023.

Venta de productos en mercados farmacéuticos e industriales

Las ventas de productos en los mercados farmacéuticos e industriales alcanzaron los $ 37.9 millones en 2023.

Segmento de mercado	Ventas de productos 2023
Mercado farmacéutico	$ 24.6 millones
Mercado industrial	$ 13.3 millones

Los ingresos totales para Codexis en 2023 fueron de $ 96.8 millones, con diversas fuentes de ingresos en múltiples segmentos comerciales.

Codexis, Inc. (CDXS) - Canvas Business Model: Value Propositions

Enabling greener, scalable RNA manufacturing via ECO Synthesis

• Codexis, Inc. is developing its proprietary ECO Synthesis® manufacturing platform to enable the scaled manufacture of RNAi therapeutics through an enzymatic route.
• The Company expected to sign a GMP scale-up partner by the end of 2025 to enable larger scale clinical and commercial siRNA production.
• In October 2025, Codexis, Inc. signed its second ECO Synthesis evaluation contract with a third party CDMO, Nitto Denko Avecia.
• As of August 2025, there were well over 30 opportunities at various stages of maturation for the ECO Synthesis platform.
• Six presentations featured the ECO Synthesis platform at the 2025 TIDES USA annual meeting in May 2025.

Delivering enzymes that outperform legacy methods in yield and quality

Codexis, Inc.'s unique enzymes can drive improvements such as higher yields, reduced energy usage and waste generation, and improved efficiency in manufacturing.

Metric	Q2 2025 Value	Q3 2025 Value	Q2 2024 Value
Total Revenues (in millions)	$15.3 million	$8.6 million	$8.0 million
Product Gross Margin	72%	64%	45%

Improving efficiency and sustainability in small molecule pharma manufacturing

• Codexis, Inc. helps partners reduce waste, lower energy consumption, and minimize the use of hazardous chemicals.
• The shift in sales toward more profitable products contributed to the Q3 2025 Product Gross Margin of 64%.
• The Company's full fiscal year 2025 revenue guidance is in the range of $64 million to $68 million.

Providing precision-tuned enzyme solutions for molecular biology and diagnostics

• The CodeEvolver® platform enables tailored enzyme solutions with improved fidelity, enhanced selectivity, and increased activity.
• The Company is focused on expanding its pipeline of enzymes sold for clinical-stage drug candidates.

Enzymes currently used in manufacturing 16 commercially approved drugs

• As of December 31, 2024, Codexis, Inc. sold enzymes as biocatalysts to pharmaceutical manufacturers for 16 therapeutic drugs that were approved for commercial sales.
• These enzymes are sold at multi-kilograms to metric tons per annum scale for commercial requirements.
• The Company was also selling enzymes for 14 drug candidates in Phase 2 and Phase 3 clinical trials as of December 31, 2024.

The Merck Supply Assurance Agreement signed in October 2025 provides a $37.8 million non-dilutive cash infusion, expected by year-end 2025.

Organizational changes enacted in November 2025 included eliminating 46 positions (about 24% of the workforce) to reduce operating expenses by an expected 25%, extending the cash runway through 2027.

Codexis, Inc. (CDXS) - Canvas Business Model: Customer Relationships

You're looking at how Codexis, Inc. (CDXS) manages its key relationships as it pivots hard into oligonucleotide manufacturing. It's defintely a relationship-driven model, especially now.

Dedicated, long-term supply relationships with major pharma

The relationship with major pharmaceutical clients is being solidified through significant, non-dilutive cash infusions tied to future supply. For instance, in October 2025, Codexis signed a $37.8 million Supply Assurance Agreement with Merck. You should note that a substantial portion of this revenue is expected to be recognized in the fourth quarter of 2025, with the remainder in the first quarter of 2026. This type of agreement signals a deep, committed relationship beyond simple transactional sales.

High-touch, collaborative development services for custom enzymes

The move toward becoming a production solutions partner is centered on the ECO Synthesis platform. The level of engagement is high-touch, moving from initial evaluation to formal contracts. As of the second quarter of 2025, Codexis reported having well over 30 opportunities at various stages of maturation for this platform. By the third quarter of 2025, this had translated into 11 active revenue-generating contracts, with another 40 opportunities in the pipeline. One customer recently used their ligase technology to produce a 3-kilogram batch of siRNA, showing the progression from lab work to tangible production scale.

The nature of these relationships is best summarized by the current partnership metrics:

Relationship Metric	Value as of Late 2025
Merck Supply Assurance Agreement Value	$37.8 million
Active ECO Synthesis Revenue-Generating Contracts (Q3 2025)	11
ECO Synthesis Opportunities in Pipeline (Q3 2025)	40
Total Opportunities in Maturation (Q2 2025)	Over 30
Expected GMP Scale-up Partner Secured By	End of 2025

Strategic partnerships to co-develop and validate new platforms (e.g., ECO Synthesis)

Codexis, Inc. relies heavily on collaborations with Contract Development and Manufacturing Organizations (CDMOs) to validate and scale its technology. In October 2025, they signed an evaluation agreement with Nitto Denko Avecia, a CDMO specializing in oligonucleotide therapeutics, for the ECO Synthesis platform. This follows earlier validation where CDMO collaborators, including Bachem and ST Pharm, presented data on their successful use of Codexis' double-stranded RNA ligases to combine short RNA fragments.

Direct sales and technical support for product enzyme customers

The structure of customer support is undergoing a deliberate change. Management signaled the decision to reduce sales and marketing efforts in the small molecule biocatalysis segment. This means the direct sales focus is shifting away from legacy products toward servicing the newer, higher-margin ligase and ECO Synthesis engagements. The company expects to sign its first development contract for its ECO Synthesis manufacturing services in the first half of 2025, which requires a different level of technical support than simply supplying off-the-shelf enzymes.

Focus on evolving from a supplier to a production solutions partner

The entire relationship strategy is geared toward this evolution. The CEO stated the Merck agreement was a key piece for the transformation into a full-service manufacturing innovator in oligonucleotide manufacturing. The company is building its own GMP manufacturing capability, with plans to sign a GMP scale-up partner by the end of 2025 to support larger clinical and commercial production. This shift is reflected in the revenue mix, where product gross margin improved to 64% in Q3 2025, up from 61% in Q3 2024, largely due to a shift in sales toward more profitable products.

Codexis, Inc. (CDXS) - Canvas Business Model: Channels

Direct sales force targeting large global pharmaceutical companies

Codexis, Inc. delivered total revenues of $8.6 million for the third quarter of 2025, a decrease from $12.8 million in the third quarter of 2024. The trailing twelve months (TTM) revenue ending June 30, 2025, was approximately $57.2 million. Management reiterated the full fiscal year 2025 total revenue guidance in the range of $64 million to $68 million.

Direct supply of proprietary enzymes to manufacturing sites

The company is moving away from promoting its historical small molecule biocatalysis business due to pricing pressure on new prospective enzyme development contracts. The Pharma Biocatalysis business impacted Q2 2025 order volumes due to variability in customer manufacturing schedules and clinical trial progression. The ligase business saw the delivery of its first order to a large pharma customer in the first quarter of 2025.

Metric	Q2 2025 Value	Q3 2025 Value
Total Revenue	$15.3 million	$8.6 million
Product Gross Margin	72%	64%

Licensing agreements for the CodeEvolver® and ECO Synthesis platforms

A significant channel for non-dilutive cash infusion and platform commitment is the Supply Assurance Agreement signed with Merck in October 2025 for $37.8 million. Codexis expects to recognize a significant portion of this $37.8 million revenue in the fourth quarter of 2025, with the remainder recognized in the first quarter of 2026. The company also executed a licensing agreement in the second quarter of 2025.

Evaluation agreements with CDMOs for platform adoption

Codexis has well over 30 opportunities at various stages of maturation related to the ECO Synthesis platform. The company signed its second ECO Synthesis evaluation contract with a third party CDMO, Nitto Denko Avecia, in October 2025. In the second quarter of 2025, three leading CDMO collaborators featured the ECO Synthesis technology in their presentations at the TIDES USA annual meeting. The first revenue-generating contract for ECO Synthesis manufacturing services was secured in the first quarter of 2025.

Internal ECO Synthesis Innovation Lab for GLP-grade material production

The company is focused on achieving pilot scale production of GLP-grade siRNA material using the internal ECO Synthesis Innovation Lab during 2025. Codexis expects to sign a GMP scale-up partner by the end of 2025 to enable larger scale clinical and commercial siRNA production.

• R&D expenses for Q3 2025 were $13.9 million.
• SG&A expenses for Q3 2025 were $11.2 million.

Codexis, Inc. (CDXS) - Canvas Business Model: Customer Segments

You're looking at the customer base for Codexis, Inc. (CDXS) as they execute a major strategic pivot in late 2025. The focus has clearly shifted toward high-value, complex therapeutics manufacturing, especially oligonucleotides.

The customer segments are distinct, moving from broad enzyme supply to targeted, high-impact platform deployment. Here's the breakdown of who is driving the current and near-term revenue expectations, which management guided to be between $64 million to $68 million for the full fiscal year 2025.

Key Customer Segments

• Large global pharmaceutical companies (e.g., Merck, Pfizer)
• Contract Development and Manufacturing Organizations (CDMOs)
• Mid-tier pharmaceutical companies focused on small molecule therapeutics
• Companies in the molecular biology and diagnostic applications space
• Innovators developing RNAi therapeutics like siRNA

The financial activity shows where the immediate value is being captured. For instance, the third quarter of 2025 saw total revenues of $8.6 million, but the underlying strategic wins are more telling about the customer mix.

Customer Segment Deep Dive and Financial Linkages

The largest global pharmaceutical players are locking in future supply and technology access. This is a critical segment for validating the new platform.

Customer Type	Key Activity/Deal	Financial Impact/Metric
Large Global Pharma	Signed Supply Assurance Agreement	$37.8 million non-dilutive cash infusion from Merck, anticipated by year-end 2025.
Large Global Pharma	Ligase Orders	Secured orders for double-stranded RNA ligases from two large pharma customers in Q1 2025.
CDMOs	Platform Adoption	Three leading CDMO collaborators featured the ECO Synthesis technology at TIDES USA 2025.
Mid-Tier Pharma	Product Mix Shift	Bench of new customers in this segment is helping drive margin improvement.
RNAi Innovators	ECO Synthesis Contracts	Secured the first revenue-generating contract for ECO Synthesis manufacturing services in March 2025.

The pivot toward oligonucleotide manufacturing is heavily reliant on innovators in the RNAi space and their manufacturing partners. Codexis, Inc. is actively building out its internal capacity to service this demand, which is a major capital commitment, but one they feel is supported by their current financial footing, extending their cash runway through 2027.

The pipeline of opportunities for the ECO Synthesis platform is substantial, showing strong market pull from these segments. Honestly, the Q3 revenue dip to $8.6 million is less concerning when you see the backlog building.

• Ongoing engagements around ECO Synthesis: well over 30 opportunities at various stages.
• Revenue-bearing contracts for the new platform: 11.
• Additional opportunities in the pipeline: approximately 40.
• Planned GMP scale-up partner signing: expected by the end of 2025.

The shift in product mix toward higher-margin offerings is evident in the gross margin figures. For Q3 2025, the product gross margin reached 64%, up from 61% in Q3 2024. This indicates that the customers driving the current revenue, particularly those utilizing the newer, more profitable enzyme solutions, are becoming a larger part of the business mix, even if overall revenue is lumpy due to customer manufacturing schedules.

Codexis, Inc. (CDXS) - Canvas Business Model: Cost Structure

You're looking at the expense side of the Codexis, Inc. equation for late 2025. It's a story of heavy investment in the future platform, even while making tough cuts to the current structure. The cost base reflects a company in transition, pivoting hard toward its next-generation technology.

The Research and Development (R&D) spend is definitely high, showing where the primary investment dollars are going. For the third quarter of 2025, R&D expenses hit $13.9 million, up from $11.5 million in the third quarter of 2024. The increase was primarily driven by higher headcount, higher lab supplies expense, and the internal reclassification of certain employees to the R&D function. This is the cost of powering the proprietary CodeEvolver® and ECO Synthesis™ platforms.

Personnel costs are a major component, even after significant adjustments. To be fair, Codexis enacted organizational changes in November 2025, eliminating 46 positions, which is approximately 24% of its workforce. They expect to recognize an additional expense of approximately $3.5 million in the fourth quarter of 2025 related to this. Still, the Q3 R&D increase suggests that the strategic R&D roles were retained or expanded, while other areas saw cuts.

The overhead, or Selling, General & Administrative (SG&A) expenses, shows some evidence of cost control following the restructuring. For Q3 2025, SG&A was $11.2 million, down from $13.6 million in Q3 2024. This decrease was primarily due to lower employee-related costs and legal expenses, plus reduced use of outside services. Honestly, managing this overhead while investing in R&D is a delicate balance right now.

The manufacturing side shows improving efficiency, which directly impacts the cost of goods sold. The Product gross margin for the third quarter of 2025 was 64%. This is an improvement over the 61% seen in Q3 2024, largely due to a strategic shift in sales toward more profitable products and away from less profitable, legacy products. You can see the trend in the margins:

Metric	Q1 2025	Q2 2025	Q3 2025
Product Gross Margin	55%	72%	64%

Furthermore, you have to factor in the costs related to physical infrastructure supporting the pivot. Codexis announced the signing of a lease for a GMP Manufacturing Facility on November 10, 2025. While the specific operating and scaling costs aren't itemized in the immediate results, this move signals future capital and operating expenditures associated with scaling up their advanced manufacturing solutions for therapeutics.

Here is a snapshot comparing the major operating expense categories for Q3 2025 versus the prior year:

• Research and Development expenses (Q3 2025): $13.9 million
• Selling, General & Administrative expenses (Q3 2025): $11.2 million
• SG&A reduction year-over-year: $2.4 million ($13.6M in Q3 2024 vs $11.2M in Q3 2025)
• R&D increase year-over-year: $2.4 million ($11.5M in Q3 2024 vs $13.9M in Q3 2025)

Finance: draft 13-week cash view by Friday.

Codexis, Inc. (CDXS) - Canvas Business Model: Revenue Streams

You're looking at a business model for Codexis, Inc. (CDXS) where revenue streams are clearly segmented, showing a transition toward higher-margin, next-generation platforms, even as overall top-line figures fluctuate based on project timing. The company has reiterated its full-year expectations, which is a key anchor for your analysis.

The overall financial expectation for the year remains firm, despite quarterly variability:

• Total revenues guided to be between $64 million and $68 million for Fiscal Year (FY) 2025.

The revenue generated from the core enzyme business and new platform services is best understood by looking at the recent quarterly performance, which shows the impact of customer manufacturing schedules:

Period	Total Revenue	Year-over-Year Change
Q3 2025	$8.6 million	Decrease of -32.98% from Q3 2024
Q2 2025	$15.3 million	Increase from $8 million in Q2 2024
Q1 2025	$7.5 million	Decrease from $17.1 million in Q1 2024
Trailing Twelve Months (TTM) ending Sep 30, 2025	$52.93 Million USD	Down -17.87% year-over-year

Specific revenue components contributing to the overall figure include the established enzyme sales, new service revenue, and upfront payments from partnerships. The shift in sales mix is also impacting profitability, as evidenced by the improving product gross margins:

• Product sales of high-performance enzymes for Pharma Biocatalysis: This segment saw increasing orders supporting late-phase and commercialized Active Pharmaceutical Ingredients (APIs) in Q2 2025.
• Development and service revenue from ECO Synthesis contracts: Codexis, Inc. secured its first revenue-generating contract for siRNA material manufacturing in March 2025, and later signed an evaluation agreement with Nitto Denko Avecia in October 2025.
• Licensing and milestone payments from platform technology agreements: Q1 2025 revenue included a $6.0 million recognition from an exclusive, global license agreement with Roche.
• Product gross margin for Q3 2025 was 64%, up from 45% in Q2 2024, reflecting a strategic shift toward more profitable products.

A significant, near-term, non-dilutive cash event is set to bolster liquidity and extend the operational runway:

• Non-dilutive cash infusion of $37.8 million from the Merck agreement: This Supply Assurance Agreement was signed in October 2025, with cash receipt anticipated by the end of 2025.